Az ELD által védett biológiai sokféleséget érintő károk nyomainak meghatározása úgy történhet, hogy az adott faj és/vagy élőhely természetvédelmi helyzetét helyi szinten (pl. azon a területen, ahol az esemény bekövetkezett), országos és biogeográfiai szinten, például az élőhely- és madárvédelmi irányelv1 2 3 jelentési adatai alapján, a természetvédelmi helyzet értékeléséhez rendelkezésre álló paraméterek felhasználásával4.
Ha Natura 2000 területről van szó, az értékelés során figyelembe kell venni az Európai Közösség Natura 2000 területekre vonatkozó szabványos formanyomtatványait5 (különleges védelmi területek (SPA), közösségi jelentőségű javasolt területek (pSCI), közösségi jelentőségű területek (SCI) és különleges természetmegőrzési területek (SAC)).
Ha nem Natura 2000 területről van szó, az értékelésnek figyelembe kell vennie az olyan paraméterek alaphelyzettől való lehetséges eltérését, mint a faj ritkasága/sűrűsége, az élőhely által lefedett terület, valamint a károsító előfordulás és károsító tényezők által negatívan érintett fajoknak és élőhelyeknek a területen való ellenálló képessége (helyreállítási képessége).
A biológiai sokféleséget érintő károkozás nyomainak és bizonyítékainak meghatározásához hivatkozni kell a HATÁS és ÁLLAPOT táblázatokra. Az alábbi 14. ábra az ÉTT által védett biológiai sokféleség károsodására utaló nyomok meghatározására vonatkozó döntéshozatali folyamatábrát mutatja be:
Döntéshozatali folyamatábra a biológiai sokféleség károsodására utaló nyomok és bizonyítékok meghatározásához

Figure 14 – Decision-making flowchart for the determination of the clues and evidence of damage to biodiversity.
1 https://cdr.eionet.europa.eu/help/habitats_art17
2 https://cdr.eionet.europa.eu/help/birds_art12
3 https://www.eionet.europa.eu/etcs/etc-bd/activities/reporting
4 Lásd az ELD I. mellékletét, valamint az élőhelyvédelmi és madárvédelmi irányelveket.
5 https://natura2000.eea.europa.eu/Natura2000/SDF.aspx?site=GR2520003#2
2 https://cdr.eionet.europa.eu/help/birds_art12
3 https://www.eionet.europa.eu/etcs/etc-bd/activities/reporting
4 Lásd az ELD I. mellékletét, valamint az élőhelyvédelmi és madárvédelmi irányelveket.
5 https://natura2000.eea.europa.eu/Natura2000/SDF.aspx?site=GR2520003#2